Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms