Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms