Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM43BQ6ZT52 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM43BQ6ZT52 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM43BQ6ZT52 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM43BQ6ZT52 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM43BQ6ZT52 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM43BQ6ZT52 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM43BQ6ZT52 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM43BQ6ZT52 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM43BQ6ZT52 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM43BQ6ZT52 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM43BQ6ZT52 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM43BQ6ZT52 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM43BQ6ZT52 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM43BQ6ZT52 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms