Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZS62

COLCA1, Colorectal cancer-associated protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLCA1Q6ZS62 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COLCA1Q6ZS62 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COLCA1Q6ZS62 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COLCA1Q6ZS62 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COLCA1Q6ZS62 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COLCA1Q6ZS62 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COLCA1Q6ZS62 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COLCA1Q6ZS62 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COLCA1Q6ZS62 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COLCA1Q6ZS62 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COLCA1Q6ZS62 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COLCA1Q6ZS62 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COLCA1Q6ZS62 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COLCA1Q6ZS62 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COLCA1Q6ZS62 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COLCA1Q6ZS62 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COLCA1Q6ZS62 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COLCA1Q6ZS62 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COLCA1Q6ZS62 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COLCA1Q6ZS62 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COLCA1Q6ZS62 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COLCA1Q6ZS62 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COLCA1Q6ZS62 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COLCA1Q6ZS62 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COLCA1Q6ZS62 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COLCA1Q6ZS62 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COLCA1Q6ZS62 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COLCA1Q6ZS62 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COLCA1Q6ZS62 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COLCA1Q6ZS62 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COLCA1Q6ZS62 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COLCA1Q6ZS62 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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