Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms