Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 ETFRF1-205ENST00000555711 783 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 AL139317.3-201ENST00000555969 898 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms