Protein–RNA interactions for Protein: Q6U736

OPN5, Opsin-5, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN5Q6U736 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OPN5Q6U736 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms