Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms