Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C1

SLC25A47, Solute carrier family 25 member 47, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A47Q6Q0C1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC25A47Q6Q0C1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A47Q6Q0C1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A47Q6Q0C1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A47Q6Q0C1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A47Q6Q0C1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A47Q6Q0C1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A47Q6Q0C1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A47Q6Q0C1 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A47Q6Q0C1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A47Q6Q0C1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms