Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms