Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6P435 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6P435 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6P435 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6P435 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6P435 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6P435 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6P435 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6P435 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6P435 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6P435 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6P435 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6P435 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6P435 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6P435 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6P435 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6P435 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6P435 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6P435 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6P435 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6P435 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6P435 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6P435 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6P435 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6P435 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6P435 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6P435 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6P435 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6P435 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6P435 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6P435 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6P435 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6P435 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6P435 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6P435 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6P435 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6P435 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6P435 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6P435 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6P435 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6P435 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6P435 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6P435 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6P435 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6P435 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6P435 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6P435 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6P435 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6P435 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6P435 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6P435 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6P435 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6P435 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6P435 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6P435 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6P435 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6P435 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6P435 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6P435 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6P435 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6P435 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6P435 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6P435 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6P435 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6P435 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6P435 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6P435 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6P435 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6P435 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6P435 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6P435 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6P435 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6P435 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6P435 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6P435 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6P435 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6P435 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6P435 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6P435 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6P435 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6P435 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6P435 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6P435 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6P435 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6P435 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6P435 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6P435 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6P435 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6P435 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6P435 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6P435 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6P435 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6P435 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6P435 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6P435 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6P435 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6P435 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6P435 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6P435 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6P435 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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