Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms