Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HMBOX1Q6NT76 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMBOX1Q6NT76 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMBOX1Q6NT76 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMBOX1Q6NT76 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms