Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms