Protein–RNA interactions for Protein: Q5TH69

ARFGEF3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF3Q5TH69 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms