Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P8

SYT6, Synaptotagmin-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6Q5T7P8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYT6Q5T7P8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYT6Q5T7P8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SYT6Q5T7P8 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYT6Q5T7P8 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYT6Q5T7P8 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYT6Q5T7P8 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT6Q5T7P8 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT6Q5T7P8 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT6Q5T7P8 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT6Q5T7P8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT6Q5T7P8 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms