Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms