Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms