Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms