Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms