Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms