Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms