Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms