Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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