Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms