Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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RTN1Q16799 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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RTN1Q16799 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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