Protein–RNA interactions for Protein: Q16778

HIST2H2BE, Histone H2B type 2-E, humanhuman

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2BEQ16778 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
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HIST2H2BEQ16778 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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HIST2H2BEQ16778 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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HIST2H2BEQ16778 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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HIST2H2BEQ16778 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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HIST2H2BEQ16778 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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