Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
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