Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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ECM1Q16610 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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ECM1Q16610 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
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ECM1Q16610 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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ECM1Q16610 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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ECM1Q16610 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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ECM1Q16610 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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ECM1Q16610 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
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