Protein–RNA interactions for Protein: Q15772

SPEG, Striated muscle preferentially expressed protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 3,267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEGQ15772 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms