Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms