Protein–RNA interactions for Protein: Q15527

SURF2, Surfeit locus protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF2Q15527 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms