Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms