Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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