Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms