Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
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