Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
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PTPRKQ15262 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
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