Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms