Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPNMBQ14956 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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