Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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RFTN1Q14699 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
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RFTN1Q14699 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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