Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CTTNQ14247 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
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