Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
COL9A3Q14050 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COL9A3Q14050 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COL9A3Q14050 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COL9A3Q14050 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COL9A3Q14050 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COL9A3Q14050 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COL9A3Q14050 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COL9A3Q14050 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COL9A3Q14050 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COL9A3Q14050 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COL9A3Q14050 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
COL9A3Q14050 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
COL9A3Q14050 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COL9A3Q14050 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
COL9A3Q14050 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COL9A3Q14050 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
COL9A3Q14050 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COL9A3Q14050 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COL9A3Q14050 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
COL9A3Q14050 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
COL9A3Q14050 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
COL9A3Q14050 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COL9A3Q14050 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COL9A3Q14050 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.32■■□□□ 1
COL9A3Q14050 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.32■■□□□ 1
COL9A3Q14050 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
COL9A3Q14050 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
COL9A3Q14050 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.32■■□□□ 1
COL9A3Q14050 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.32■■□□□ 1
COL9A3Q14050 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
COL9A3Q14050 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
COL9A3Q14050 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COL9A3Q14050 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COL9A3Q14050 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COL9A3Q14050 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
COL9A3Q14050 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COL9A3Q14050 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COL9A3Q14050 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COL9A3Q14050 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COL9A3Q14050 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COL9A3Q14050 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COL9A3Q14050 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COL9A3Q14050 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COL9A3Q14050 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.31■■□□□ 1
COL9A3Q14050 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL9A3Q14050 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL9A3Q14050 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL9A3Q14050 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COL9A3Q14050 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.31■■□□□ 1
COL9A3Q14050 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.31■■□□□ 1
COL9A3Q14050 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
COL9A3Q14050 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
COL9A3Q14050 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.31■■□□□ 1
COL9A3Q14050 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COL9A3Q14050 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL9A3Q14050 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL9A3Q14050 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.31■■□□□ 1
COL9A3Q14050 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL9A3Q14050 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COL9A3Q14050 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL9A3Q14050 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL9A3Q14050 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COL9A3Q14050 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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