Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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