Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
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