Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms