Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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SP140Q13342 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SP140Q13342 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SP140Q13342 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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SP140Q13342 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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SP140Q13342 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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SP140Q13342 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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SP140Q13342 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SP140Q13342 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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SP140Q13342 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SP140Q13342 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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SP140Q13342 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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SP140Q13342 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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SP140Q13342 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SP140Q13342 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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SP140Q13342 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SP140Q13342 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SP140Q13342 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SP140Q13342 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SP140Q13342 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SP140Q13342 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SP140Q13342 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SP140Q13342 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP140Q13342 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP140Q13342 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP140Q13342 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP140Q13342 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SP140Q13342 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP140Q13342 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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