Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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SGCGQ13326 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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SGCGQ13326 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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