Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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SEMA3FQ13275 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
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