Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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