Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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ERCC8Q13216 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ERCC8Q13216 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ERCC8Q13216 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ERCC8Q13216 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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ERCC8Q13216 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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ERCC8Q13216 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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ERCC8Q13216 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
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ERCC8Q13216 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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ERCC8Q13216 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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ERCC8Q13216 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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